创新中心主管单位为江苏省自然资源厅，依托单位为南京信息工程大学，联合江苏省测绘工程院、航天宏图信息技术股份有限公司、江苏苏海信息科技（集团）有限公司共同建设，形成集技术研发、产品工程化、科技成果转移转化和产业化应用于一体的技术创新与转化平台。

（1）工程创新中心实行依托单位领导、技术委员会咨询下的主任负责制。

（2）设主任1名，副主任3名。创新中心主任由本领域高水平的学术带头人担任，具有较高的学术技术水平、较强的组织管理能力和协调能力。主任由依托单位技术专家担任，副主任由共建单位各指派1名。

（3）设立管理委员会和技术委员会。

（4）设立综合办公室，主要负责工程创新中心行政人事、项目、财务等日常运行管理。

（5）设立工程研发部，主要负责产品的集成、包装、维护与升级。

（6）设立技术服务部，主要负责产品交付与安装调试及产品售后服务。

（7）设立市场营销部，主要负责市场环境需求调研，对潜在产品进行调查和分析，负责产品应用推广。